З 1979 по 2003 роки Іван Хвойка працював військовим льотчиком та інструктором на літаках L-29 та L-39. Він також був командиром знаменитої акробатичної групи Biele Albatrosy. З 2003 року працює пілотом, інструктором та екзаменатором з кваліфікацією для різних типів гвинтових літальних апаратів, таких як C-152, C-172, Z-226, Z-142, Z-242, P-2006, L-200, DA-20, ECHO a SD-4.